神水宮是江湖中的傳說，它從來不參與江湖紛爭，亦沒有人知道它的真身究竟在何處。近日來，武林幫派的各大幫主接連因為中了神水宮的天一神水之毒而命喪黃泉，一向風流倜儻的楚留香（狄龍 飾）則被誤會為了神水宮的幫凶而遭到唾棄。
為了洗清冤情，楚留香決定和李紅袖等人調查事件的真相，在一番波折之後，楚留香總算得以打入了神水宮的內部，卻發現這裏的確是清靜之地。原來，所有的命案都係楚留香昔日的好友無花和尚所為，然而，當楚留香想要離開神水宮將真相公之於眾時，卻遭到了神水宮主的拒絕，隻因為楚留香得知了她有一私生女的秘密。