明治11年，通過大久保卿遭到暗殺事件，誌誌雄真實在背後主持的京都破壞計劃逐漸浮出水麵。巻町操接到京都禦庭番眾的首領的命令，去尋找擁有力量阻止這一切的劍客緋村劍心。在從東海道往京都行進途中，她發現了劍心，曾經擁有拔刀齋名號讓人恐驚，又是明治維新幕後助力者的劍心，兩人一起上路，可是真實的劍心卻讓操不敢相信。