故事設定在2272年，它將以兩條相關聯的劇情主線交替上場為特色，但是之間會有72小時的時間間隔：第一條是跟隨星際聯盟總統約翰·謝裏登，在他去巴比倫5號參加慶祝星際聯盟建盟十周年紀念日的路上。在路途中，他意外地在聖塔利領空的邊境碰到了聖塔利親王Vintari攝政王(在聖塔利帝國的寶座中排行第三)，並收到一個來自技術法師蓋倫的警告，說有事情將要產生。第二條線的重點是蘿莉上校(以前的上尉，在電視劇裏)在巴比倫5號上等待謝裏登的到來，她從地球領空叫來了一個牧師來幫助她處置一個神秘事件，表麵上看起來似乎是個超自然的問題。