雖然電視指南(TV Guide)認為《深空九號》在「演、編、製以及整體而言都是最好的星艦係列劇集」,然而很多傳統星艦迷一開始並不能完全接受它,有人說它背棄了星艦原創人吉恩羅登貝瑞的原始構想,不過根據報導,羅登貝瑞在死前認可了這個劇集的概念。 「DS9」顛複了以往Star Trek係列對未來世界過分理想化的描述,它是由一個廢棄的采礦站加上默契欠佳的成員所組成的,而且由於深空九號太空站的地理位置和特殊的外交,站長偶爾就必須在有意無意間忽視或違背星際聯邦的「最高指導原則」,在這許多不完美的條件下,發展出新的風格和管理的方式。「DS9」裏所刻劃的星艦時空是一個介於銀河裏各個大國之間的強權政治時代,基本上「DS9」偏重於探討戰爭、宗教、政治妥協以及其他現代議題等等,很多人性的黑暗麵都會在劇集中表露無疑,然而對於外來種族執意的侵略,為了保護聯邦無辜的公民,星際聯邦隻好讓戰爭在邊境發生,這場戰爭打了四年,「DS9」後期的劇情就以這場「自治同盟戰爭」為主軸,主角們也漸漸獲得成長,和一開始成員間的不協調已經完全不同了。