“男塾”——繼續武士道精神、以培養真正的男子漢為目標的寄宿製私塾——今年又迎來了一批生龍活虎的新生，其中包括文武雙全沉默寡言的劍桃太郎、性格堅韌頑強的源次、在山裏長大的虎丸，以及膽小軟弱的秀麻呂。秀麻呂是黑道小開，母親看他不成器，特地把他送進這所學校磨煉。 男塾的練習非常嚴酷，教官們也毫不容情。秀麻呂不堪忍受逃了出去，最終還是回到了學校，桃太郎自願和他一起受罰。同甘共苦的生活讓一號生們建立起了深厚的友情。 與男塾有私怨的伊達臣人集結起一群實力高手組成關東豪學連攻進塾內。塾長製止了混戰，提出用“驚邏大三凶殺”來決勝敗。所謂“驚邏大三凶殺”是擁有數百年曆史的決鬥方式，兩隊必須各選出三名成員在三處險境中生死相搏。第一凶“崩落密閉關”，在危險的洞窟中，虎丸施展自創拳法力拚中國拳術達人月光。第二凶“斷崖宙亂關”，源次與美少年飛燕在懸崖峭壁上進行空中死鬥。第三凶“頂麓大泥疊關”，在灼熱的岩漿池上，隻有幾塊凸起的岩石可以落腳，桃太郎和豪學連總長伊達在此展開最後的決戰…… 此時，塾生們聚集在富士山下的古寺寶獄院中為桃太郎助威。秀麻呂受到激勵也終於鼓起了勇氣，身材瘦小的他奮力揚起重達三百公斤的塾旗。桃太郎與伊達的死鬥將決定男塾的未來……