在十七世紀的日本，一個男孩降生於貧苦的小村。他叫卡姆依，長大後成了一名擁有堅忍意誌和高超劍術的忍者。漸漸地，卡姆依開始質疑忍者世界的重重陳規與無情殺戮，他脫離了忍者集團，去追尋真正的自由，就此成了叛徒遭到追殺。曾經並肩作戰的同伴大頭、三雲對他窮追不舍，卡姆依並不想和他們做你死我活之鬥，為了生存下去隻得踏上逃亡之旅。 卡姆依碰到了狡猾而本性善良的漁夫半兵衛。半兵衛把卡姆依帶回了家，讓他大吃一驚的是，半兵衛的妻子竟然是和他一樣的逃亡忍者縋流。多年前，卡姆依曾參加過追殺縋流的行動，將她逼落懸崖。縋流固執地認為卡姆依是追兵，一直伺機要將之殺死。而半兵衛的女兒沙耶香卻暗暗愛上了卡姆依。 由於遭人告密，半兵衛被藩主水穀軍兵衛抓走即將處決。卡姆依和縋流冒險劫法場將他救了出來。 為了尋找新的立腳謀生之地，半兵衛一家和卡姆依駕船出海。他們在海上遭遇風暴，還碰到了鯊魚群。危急時刻，解救他們的是傳說中的獵鯊軍團“渡眾”。渡眾的首領不動將卡姆依一行接上千石船，帶著他們來到幸島。卡姆伊起初並不信任渡眾，在知道他們也是脫離集團的忍者後，才放下了戒心。他開始跟隨不動與眾人一起行動。同時，他與沙耶香也互通了心意。初次體會到了人與人之間暖和的卡姆依沉浸在幸福之中。然而美好的時光並不長久，追殺而來的忍者集團已然逼近……