海賊王空島特別篇動畫全集講述了以海賊王為目標的少年蒙奇·D·路飛，將索隆、娜美、烏索普、山治、喬巴、以及Nico·羅賓加入了新的夥伴，繼續航行。這時，在他們身邊，巨大的船從天空落下。路飛們避開掉落的船，得救了。在令人吃驚的他們的身邊被風吹到的“星巴邦”的地圖，那是對天空之地“空島”的地圖。但是，突然天空突然出現了一個巨人的影子。摸索到空島的路飛們在傑亞遇到了海賊勃朗峰·克裏特。板球是400年前成為繪本的“騙子諾蘭”的不光彩的探險家的子孫。但是，板球的祖先諾蘭不是說謊，而是真的去了空島。作為證據，路飛們知道了在航海日誌中描繪的衝擊的事實。然後，路飛們知道，作為去空島的唯一線索，必須要被細菌海流吞噬。穿過強烈的海流的目的地，是在雲上島上存在的神之國·斯基亞。在喜悅的草帽一夥中出現了空之騎士·福爾和天空的居民科尼斯。但是，那裏是被稱為全能神的艾爾支配的國家…。