《宇宙護衛隊》第一季故事圍繞著正直勇敢的隊長老虎“風暴”，天生的行動派猴子“閃電”，知識淵博頭腦聰明的兔子“彩虹”三位宇宙護衛隊隊員展開。他們樂於助人、幫助不同的小動物們解決各類問題，三人相互協作，一同保護地球上的動物居民。每一集他們都會幫助一個小動物，並在執行任務的過程中學會接納彼此的不同。而在幫助每個小動物的過程中，他們也會了解到這些動物身上的特征，比如海馬是爸爸負責“生育”寶寶，豬的嗅覺居然比狗還靈敏等等。