當莉洛（黛維·切斯 Daveigh Chase 配音）和史迪奇（克裏斯·桑德斯 Chris Sanders 配音）終於完成了他們的任務之後，史迪奇即將和賈巴博士（大衛·奧根·斯提爾斯 David Ogden Stiers 配音）以及普利凱利（凱文·麥克唐納 Kevin McDonald 配音）一起返回他們的星球，然而，就在這個節骨眼上，一個名為勒羅伊（克裏斯·桑德斯 Chris Sanders 配音）的邪惡試驗品浮出了水麵。 

野心勃勃的漢姆斯特維爾博士（傑夫·貝內特 Jeff Bennett 配音）想要將極為危險的勒羅伊複製成為一支軍隊，統治整個宇宙。為了粉碎漢姆斯特維爾博士的陰謀，莉洛和史迪奇再度合作，他們所要麵對的，是和往日不同的，強大而又危險的敵人。