曾經罪惡橫行的高譚市，自布魯斯·韋恩（彼得·威勒 Peter Weller 配音）決定以蝙蝠俠的身份歸來後，仿佛終於發生了新的變化。變種人頭目雙麵人被除掉，然而原變種人團夥搖身變成蝙蝠狂熱者，以暴力的方式執行著對善惡之行的裁斷。因此，蝙蝠俠的法外行為引起廣泛爭論，甚至驚動白宮，而高譚的新任探長對其存在頗有微詞。正值美蘇交惡的危機時刻，超人（馬克·瓦雷 Mark Valley 配音）卷入戰火，蝙蝠俠和這位昔日的戰友因理念不同分道揚鑣。在此期間，小醜（邁克爾·愛默生 Michael Emerson 配音）高調複出，受邀參加某電視節目訪問，實則暗藏新的陰謀。 

為了阻止小醜的破壞，蝙蝠俠和新一代的羅賓突破重重阻隔，殺向對手……