自那之後，已經過去了5年。5年前的雨神作戰並沒有將Amazon事態徹底平息，而是迎來了意想不到的新局麵。普通人毫無預兆地Amazon化的現象在持續擴大，政府政府組成了新組織“4C”，秘密暗殺Amazon化的人們，打算隱藏真相。被強烈的吃人衝動所折磨,與他人保持的距離的“被作為Amazon培育”的少年千翼,假麵騎士亞馬遜?新。在他的麵前，出現了一位能夠變身為烏鴉Amazon的少女?優。優用駭人的戰鬥力打倒了其他Amazon。目睹到優的千翼受到了衝擊——優是他第一次沒有產生吃人衝動的作為“人”的對象，千翼第一次有了想要接近的人。然而，千翼所不知道的是，優是被Amazon化的父親殺死後,作為以前的Sigma類型複活的生物兵器。。。