故事內容延續第一部TV版攻殼機動隊STAND ALONE COMPLEX的劇情繼續發展。但TV版的2部作品與劇場版無甚聯係，可以看做是兩個平行世界裏發生的事情。 

這次TV版第2季的製作班底與第一部相同，同時劇情表達上和第一季一樣，每話由不同故事構成，各自獨立成章，卻貫穿著同一條主線。在劇情上同時電影版導演押井守也參與了協力，不過電影版中淒涼的氣氛沒有在TV版第二季中體現。